Celem programu WSPÓŁPRACA (COOPERATION) jest wspieranie różnych form współpracy ponadnarodowej w Unii i poza nią, w kilku obszarach tematycznych odpowiadających głównym dziedzinom wiedzy i technologii, w których konieczne jest wspieranie i umacnianie najwyższej jakości badań w celu sprostania wyzwaniom natury społecznej, gospodarczej, środowiskowej oraz przemysłowej w Europie.

W ramach działań Wspólnoty określono dziesięć następujących tematów:

• Zdrowie (Health Research)

1. Biotechnologia, podstawowe narzędzia i technologie medyczne dla zdrowia ludzkiego.
2. Przekładanie badań na rzecz ludzkiego zdrowia na praktyczne zastosowania.
3. Optymalizacja usług opieki zdrowotnej świadczonych obywatelom europejskim.

• Żywność, rolnictwo i biotechnologia (Food, Agriculture and Fisheries, and Biotechnology)

1. Zrównoważona produkcja i gospodarka zasobami biologicznymi środowiska lądowego, leśnego i wodnego.
2. "Od stołu do gospodarstwa".
3. Nauki o życiu i biotechnologia na rzecz zrównoważonych produktów i procesów nieżywnościowych.

• Technologie informacyjne i komunikacyjne (Information and Communication Technologies)

1. Filary technologii ICT.
2. Integracja technologii.
3. Badania nad zastosowaniami.

• Nanonauki, nanotechnologie, materiały i nowe technologie produkcyjne (Nanosciences, nanotechnologies, materials & new production technologies)

1. Nanonauki, nanotechnologie.
2. Materiały.
3. Nowa produkcja.
4. Integracja technologii na rzecz zastosowań przemysłowych.

• Energia (Energy Research)

1. Wodór i ogniwa paliwowe.
2. Wytwarzanie energii elektrycznej ze źródeł odnawialnych.
3. Produkcja paliw odnawialnych.
4. Paliwa odnawialne wykorzystywane do ogrzewania i chłodzenia.
5. Technologie wychwytywania i składowania dwutlenku węgla w celu bezemisyjnego wytwarzania energii.
6. Czyste technologie węglowe.
7. Inteligentne sieci energetyczne.
8. Efektywność energetyczna i energooszczędność.
9. Wiedza na rzecz polityki energetycznej.

• Środowisko (w tym zmiany klimatu) (Environment including Climate change)

1. Zmiany klimatu, zanieczyszczenie środowiska i zagrożenia (Niekorzystne oddziaływanie na środowisko i klimat. Środowisko i zdrowie. Zagrożenia naturalne.).
2. Zrównoważone gospodarowanie zasobami (Ochrona i zrównoważone gospodarowanie zasobami naturalnymii wytworzonymi przez człowieka oraz różnorodność biologiczna. Gospodarowanie srodowiskami morskimi.).
3. Technologie środowiskowe (Technologie środowiskowe. Ochrona i rozwój dziedzictwa kulturowego. Ocena, weryfikacja i testowanie technologii.).
4. Narzędzia obserwacji i oceny Ziemi (Systemy obserwacji Ziemi i oceanów oraz metody monitorowania środowiska i zrównoważonego rozwoju.)

• Transport (w tym aeronautyka) (Transport including aeronautics)

1. Aeronautyka i transport lotniczy (Ekologiczny transport lotniczy. Podnoszenie efektywności czasowej. Zapewnianie zadowolenia i bezpieczeństwa klientów. Poprawa efektywności pod względem kosztów. Ochrona samolotu i pasażerów. Transport lotniczy przyszłości.).
2. Zrównoważony transport powierzchniowy - kolejowy, drogowy i wodny (Ekologiczny transport powierzchniowy. Promowanie i pobudzanie zmian w wyborze środków transportu i rozładowywanie ruchu w korytarzach transportowych. Zapewnianie zrównoważonej mobilności miejskiej wszystkim obywatelom, także mniej uprzywilejowanym. Poprawa bezpieczeństwa i ochrony.Wzmacnianie konkurencyjności.).
3. Wspieranie europejskiego globalnego systemu nawigacji satelitarnej (Galileo i EGNOS).

• Nauki społeczno-ekonomiczne i humanistyczne (Socio-economic Sciences and Humanities)

1. Wzrost gospodarczy, zatrudnienie i konkurencyjność w społeczeństwie wiedzy.
2. Łączenie celów ekonomicznych, społecznych i  środowiskowych w perspektywie europejskiej.
3. Główne tendencje w społeczeństwie i ich konsekwencje.
4. Europa w świecie.
5. Obywatel w Unii Europejskiej.
6. Wskaźniki społeczno-ekonomiczne i naukowe.
7. Badania wybiegające w przyszłość (foresight).

• Przestrzeń kosmiczna (Space)

1. Wykorzystanie przestrzeni kosmicznej na rzecz społeczeństwa europejskiego (GMES. Innowacyjne usługi łączności satelitarnej. Rozwój technologii i systemów monitorowania. Zastosowania funkcjonujących w przestrzeni kosmicznej systemów zapobiegania ryzyku.).
2. Badania przestrzeni kosmicznej (Zapewnianie wsparcia BRT. Wspieranie koordynacji działań.).
3. BRT na rzecz wzmocnienia obecności w przestrzeni kosmicznej (Badania i rozwój. Nauki o kosmosie.).

• Bezpieczeństwo (Security)

1. Bezpieczeństwo obywateli.
2. Bezpieczeństwo infrastruktur i obiektów użyteczności publicznej.
3. Inteligentna obserwacja i bezpieczeństwo granic.
4. Przywracanie bezpieczeństwa i ochrony w sytuacjach kryzysowych.
5. Integracja systemów bezpieczeństwa, łączność i interoperacyjność.
6. Bezpieczeństwo i społeczeństwo.
7. Koordynacja i ustrukturyzowanie badań nad bezpieczeństwem. 

Ponadnarodowa współpraca w ramach wszystkich tematów będzie wspierana przez:
 

• Badania realizowane w ramach współpracy - ich celem jest tworzenie doskonałych projektów i sieci badawczych w zakresie głównych dziedzin rozwoju wiedzy, będących w stanie przyciągać naukowców i inwestycje z Europy i całego świata. Cel ten zostanie osiągnięty poprzez wspieranie badań realizowanych w ramach współpracy przy pomocy wielu systemów finansowania: wspólnych projektów, sieci doskonałości, działań koordynacyjnych/wspierających.
• Wspólne inicjatywy technologiczne - tworzenie długoterminowych partnerstw publiczno-prywatnych, połączą inwestycje sektora prywatnego z krajowymi i europejskimi środkami publicznymi.
• Koordynowanie pozawspólnotowych programów badawczych - działania podjęte w tej dziedzinie prowadzone będą przy pomocy dwóch głównych instrumentów: systemu ERA-NET oraz uczestnictwa Wspólnoty we wspólnie wdrażanych krajowych programach badawczych.
• Współpraca międzynarodowa - obejmuje działania służące zwiększeniu udziału naukowców i instytucji badawczych z krajów trzecich, w obszarach tematycznych; a także szczególne działania w zakresie współpracy w każdym z obszarów tematycznych dotyczące krajów trzecich w przypadku wzajemnego zainteresowania współpracą w określonych dziedzinach, które zostaną wybrane na podstawie poziomu i potrzeb naukowych i technologicznych danych krajów.